Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo4Q8CHQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms