Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip3Q8CHD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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