Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnka2ipQ8CH19 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms