Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms