Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nup88Q8CEC0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup88Q8CEC0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms