Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef8Q8CE24 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Pramef8Q8CE24 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pramef8Q8CE24 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pramef8Q8CE24 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pramef8Q8CE24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef8Q8CE24 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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