Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc87Q8CDL9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc87Q8CDL9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms