Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lancl3Q8CD19 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms