Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms