Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spef2Q8C9J3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spef2Q8C9J3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms