Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe22Q8C6A8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms