Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C5C9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms