Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska3Q8C263 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms