Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms