Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms