Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh12Q8BYK4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh12Q8BYK4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms