Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrtm1Q8BXQ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms