Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms