Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Catsper4Q8BVN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms