Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep55Q8BT07 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep55Q8BT07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms