Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms