Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LsampQ8BLK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms