Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp54Q8BL06 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp54Q8BL06 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms