Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW7

Eme1, Crossover junction endonuclease EME1, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme1Q8BJW7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme1Q8BJW7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297.2 ms