Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms