Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
D130040H23RikQ8BII3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms