Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp4f39Q8BGU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms