Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smndc1Q8BGT7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms