Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubash3bQ8BGG7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ubash3bQ8BGG7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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