Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4bQ8BGE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms