Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD5

Cpt1c, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1cQ8BGD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpt1cQ8BGD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpt1cQ8BGD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms