Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt12Q8BG71 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms