Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4cQ811C2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atg4cQ811C2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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