Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms