Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim19Q80ZU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim19Q80ZU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms