Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClspnQ80YR7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClspnQ80YR7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms