Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed4Q80WQ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Zbed4Q80WQ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms