Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnupnQ80W37 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms