Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Lrrc1Q80VQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms