Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b1Q80VQ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms