Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prickle3Q80VL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prickle3Q80VL3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms