Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube3cQ80U95 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3cQ80U95 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms