Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims3Q80U57 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims3Q80U57 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms