Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms