Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnkQ7TSL0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms