Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf516Q7TSH3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf516Q7TSH3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms