Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms