Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms