Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPE5

Slc7a6os, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a6osQ7TPE5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc7a6osQ7TPE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc7a6osQ7TPE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms