Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim46Q7TNM2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim46Q7TNM2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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